Le musée archéologique de Sozopol est situé dans la vieille partie de la ville. Le musée retrace l'histoire séculaire de la ville, depuis la fin du VI millénaire avant J.C. jusqu'au XVII siècle. Le musée est structuré autour de deux thèmes centraux : l'archéologie et l'art chrétien (XVII – XIX siècles).
Le musée garde également le coffret en albâtre qui enfermait durant des siècle les reliques de St. Jean Le Baptiste, ainsi que la petite boîte qui raconte le déplacement des reliques à l'île de St. Jean (Sveti Ivan). Les reliques ont été découvertes en 2010 lors de fouilles archéologiques sur l'île.
Aujourd'hui, les reliques sont gardées à l'église St. St. Cyrille et Méthode.